Voulez vous aider la science

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  • Galeric
10/02-2006 à 18:39Bonjour,

Chaque jour, des millions de personnes
souffrent ou meurent
de maladies telles que le SIDA, le
cancer, la malaria et bien d'autres encore.
Tout le monde les connait, tout le monde a eu au moins une personne de son entourage
confrontée à une de ces maladies. Aujourd'hui, avec le développement d'internet,
apparaissent de nouvelles méthodes de recherches, de nouveaux
espoirs, de nouvelles promesses.

VOUS POUVEZ AIDER LA RECHERCHE !

Grâce au calcul partagé, la science peut progresser. Témoin
ce projet lancé dans le cadre du Téléthon 2001 par l'AFM , le DECRYPTHON dont
vous avez peut-être entendu parler. Le projet repart, et a besoin de nous tous
!

Il existe une plateforme de calcul partagé, qui participe à
plusieurs projets de ce type : BOINC (Berkeley Open Infrastructure
for Network Computing). Les projets ont pour but de rendre publics le
résultats des recherches. Aucune intention mercantile! Pour reprendre l'expérience
du décrypthon :

http://www.infobiogen.fr/services/bdd/bdd.php?page=decrypthon




Comment se passe le calcul partagé
:

Lorsqu'il est en veille, votre ordinateur envoie une demande
de données au serveur du projet. Il effectue ensuite des calculs sur ces données,
renvoie les résultats au serveur et lui demande un nouveau bloc de données.


Chaque calcul effectué par votre ordinateur fournit aux scientifiques
des informations essentielles qui permettent d'accélérer le rythme des recherches
!

L'installation est simple, et vous n'avez plus rien à faire
par la suite ! Il faut installer le logiciel et s'inscrire à un des projets.

Pour participer vous aussi, téléchargez
le logiciel

http://boinc.berkeley.edu/download.php

Ensuite, pour choisir le projet que vous
voulez aider, obtenir des renseignements, rendez vous sur le site d'une équipe
francophone :

http://www.boincfrance.org

Les projets d'ordre biomédical sont SIMAP, PROTEINPREDICTOR,
ROSETTA, WORLD COMMUNITY GRID, et d'autres vont apparaître.

Pour que la recherche avance le plus rapidement possible, il
est important de faire connaitre le calcul partagé. Aussi je vous invite à transmettre
ce mail à vos contacts, d'en parler autour de vous.

CONTINUEZ LA CHAINE, ET AIDEZ LA RECHERCHE


10/02-2006 à 18:48Je le laisse au bistrot, puisqu'il a attéri là [;)]

Il y aussi Folding :

[QUOTE]Votre ordinateur au secours de la recherche sur les protéines: Le projet Folding@Home]

Le département de chimie de l'université de Stanford a développé une nouvelle méthode pour comprendre comment les protéines se "plient" (du verbe anglais : to fold). Cette méthode utilise un nouvel algorithme permettant de découper des simulations normalement tres coûteuses en calculs en petites fractions, et ceci dans le but de distribuer le travail sur plusieurs ordinateurs...............[/QUOTE]

J'ai pas tout mis mais :

http://www.alliancefrancophone.org/presentation.html


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Voulez vous aider la science
  • Galeric
10/02-2006 à 18:59

Je le laisse au bistrot, puisqu'il a attéri là

ça tombe bien c'est là que je voulais qu'il soit

Il y aussi Folding

Comme j'ai déjà du le dire ici, c'est là un des projets. Ce projet est actuellement en phase de test pour pouvoir bientôt tourner également sous BOINC.


Ce qui est présenté ci dessus, BOINC, est en fait une sorte de boite qui permet de regrouper différents projets de calculs partagés rendant plus facile leur gestion sur un ordinateur.

Une liste des projets que l'on peut faire tourner avec BOINC est disponible ici :
http://team-est.boinc.fr/viewtop.php?t=305

En supplément gratuit je vous donne la page d'acceuil du site des Boinceurs de la moitié EST de la France
http://team-est.boinc.fr/portal.php

Modifie par Modifié par Galeric le 10/02/2


  • Galeric
10/02-2006 à 19:51Il y a un projet qui est attendu par pas mal de monde, on se demande pourquoi ? [;)]

Orbit@home

Le but du projet orbit@home est de détecter une éventuelle collision entre un astéroïde et la Terre dans les prochaines années.
Le principe est simple : en connaissant la trajectoire actuelle des astéroïdes détectés de partout à travers le monde, il est relativement facile de prévoir la trajectoire de ceux-ci afin de prévoir des collisions entre des astres et ces astéroïdes. Orbit@home permettra donc , en théorie de répertorier toutes les trajectoires des astéroïdes connus afin de prévenir les risques sur Terre mais aussi de pouvoir observer une éventuelle collision avec une autre planète du système solaire.
Le projet se basera sur les bases de données de la NASA, le JPL(jet propulsion labotary), et d'autres observatoires mondiaux (NEOdys, astdys et MPC) qui mettent à la disposition tous les astéroïdes répertoriés.
Le projet est mené par l'université de Washington. Actuellement il existe déjà un logiciel en beta-test mais il n'est pas encore porté sur la plate-forme BOINC. Le beta-test du logiciel orbit@home/BOINC devrait commencer au printemps 2005.

Un beta-test est en cours avec 1000 participants. Le but est de créer le site web ainsi que les applications, les graphiques du projet.
Lors de ce beta-test, seront également testés d'autres programmes d'étude de mécanique céleste. Ces applications tourneront cependant avec une priorité moindre par rapport à l'étude principale qui est l'étude des trajectoires d'astéroïdes.


12/02-2006 à 17:56Salut, cela me semble si bizarre ce truc rien que pendant le transfert des données sur le net et la lenteur de nos PC par rapport à un Sun qui aura résolu l'application distribuée en un rien de temps, sans compter sur les c....s qui vont tripoter le logiciel sur le PC qui vont contaminer les données, moi je n'y crois pas ?

Bonne soirée


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Voulez vous aider la science
12/02-2006 à 19:37Sceptique également ...

Pour reprendre le dernier exemple de Galeric, le comportement des astres porte le nom savant de 'modèle chaotique' [:D]
Celà ne signifie pas que les astéroïdes n'en font qu'à leur tête, mais que la plus petite erreur de calcul (suite, par exemple à l'influence mutuelle de 2 astéroïdes) nécessite la révision complète de toutes les prévisions. Mais cette révision prend quelques secondes seulement sur un ordinateur costaud.

Le calcul partagé est d'une grande utilité pour les calculs longs et permanents, pas pour les évènements ponctuels.

Ceci dit, les liens de Galeric cités en début de topic, et les calculs d'ingénérie génétique en général rentrent certainement dans la catégorie ou le calcul partagé peut aider.

Encore une fois, méfiance au niveau d'une certaine désinformation.


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Il faut bien que je supporte deux ou trois chenilles si je veux connaître les papillons (A. de Saint-Exupery) image


12/02-2006 à 19:56'Modèle chaotique' cela fait penser à mon épouse [:D]
Pour la comprendre il faudrait aussi un logiciel en partage sur des milliers d'ordinateur [:o)]


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12/02-2006 à 19:58C'est pas de la Désinformation [:o]

C'est comme pdt le téléthon avec le décrypthon [;)] que Galeric à du en parler ci-dessus [:)(]

N'hésitez pas à venir nous rejoindre, en installant un petit logiciel sur votre ordinateur, vous pouvez aider grandement la recherche. Ce logiciel n'interfere pas avec le fonctionnement de votre ordinateur, ni avec votre travail, il se connecte de temps en temps pour envoyer un résultat et en même temps demander du travail aux serveurs du projet à l'université de Stanford.

De plus, la participation à un challenge utile n'est pas l'unique motivation qui a poussé des milliers de gens à aider le projet, l'entraide entre les "foldingueurs" (ou "francoplieurs", ou tout simplement "plieurs"), comme se sont surnommés les internautes francophones participant au projet Folding@Home, ou encore la lutte pour gagner des places au classement mondial font aussi partie des "goodies" apportées par cette participation................



Cliquez et lisez les liens qu'on vous donne [;)]


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Voulez vous aider la science
13/02-2006 à 02:26C'est vrai, Miss, mais je parlais du dernier lien donné par Galeric (orbit@home), et non pas des liens donnés en tête de topic [;)]

Jeanmy, je compatis. J'imagine un PC qui posséderait une logique féminine [°)] [:o)] [:D]

- impossible à éteindre
- impossible de couper le son
- impossible à échanger
- impossible à ... (à compléter par chacun)


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Il faut bien que je supporte deux ou trois chenilles si je veux connaître les papillons (A. de Saint-Exupery) image


  • Galeric
13/02-2006 à 10:33Pour le orbit@home qui est à venir, il est possible d'en savoir un peu plus sur le site actuel du projet http://orsa.sourceforge.net/atwork.html mais c'est tout en anglais

13/02-2006 à 10:49[QUOTE]Jeanmy, je compatis. J'imagine un PC qui posséderait une logique féminine [°)] [:o)] [:D]

- impossible à éteindre
- impossible de couper le son
- impossible à échanger
- impossible à ... (à compléter par chacun)[/QUOTE]

Seven [:o] image image


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13/02-2006 à 13:46

impossible à échanger



Si,si Simon a plein d'adresse d'échangiste au Canada [:D]


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  • Galeric
14/02-2007 à 16:03image

Aprés deux semaines de combats acharnés, l'Alliance Francophone vient de résister à un assaut Australien sur le projet ABC.

Parler de résistance est trés gentil, il s'agirait plutôt d'une pulvérisation de kangourous.

Tous les détails du fight ici : http://forum.boinc.fr/boinc/LAllianceFrancophone/Fights/fight-mobilisation-abc-sujet_174_1.htm

Resultats en images pour deux semaines de lutte : http://itrilium.dyndns.org/af_boinc/stats_aa5/index.php

Mais à propos, qu'est-ce que c'est que la conjecture ABC ?
http://www.boinc-af.org/index.php?option=com_content&task=view&id=298&Itemid=215

image

image


Animations sur la lithographie d'Escher : http://escherdroste.math.leidenuniv.nl/index.php?menu=animation Choisir MPEG ou AVI et la taille du fichier, suivant votre lecteur media et vitesse connection.

Modifie par Modifié par Galeric le 14/02/2


14/02-2007 à 18:08oki pour BOINC, je fais partie de deux projet - celui dont tu parles et Rosetta - depuis pas mal de temps. Je peux témoigner qu'il n'y a aucune répercussion sur la bonne marche du PC ...

Voulez vous aider la science
  • Galeric
14/02-2007 à 18:38Bravo, en ce qui me concerne je viens de réussir à m'inscrire sur malaria control, cela faisait longtemps que ce projet m'interressait mais les inscriptions étaient bloquées à chaque fois que je tentais d'y acceder...

Je viens de remettre Rosetta en route après une longue période d'arret, due au fait que j'avais mis toutes les ressources sur Climat Prediction, les unités de calcul pour ce projet sont énormes (environ 2500 à 3000 heures de calcul)

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Climat1

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Climat 2

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climat 3

14/02-2007 à 18:50j'ai un tuto de prêt pour ceux que cela intéresse [8D]

25/03-2007 à 01:21image

Les 23, 24 et 25 mars, Sidaction organise comme tous les ans trois journées de collecte, de sensibilisation et de mobilisation contre le sida dans toute la France et sur les médias. Le thème retenu cette année est celui de la solidarité.

Pour mettre en pratique cette solidarité, au delà des dons que vous pourriez faire pour le Sidaction, vous pouvez aussi choisir d'utiliser le temps libre de votre processeur pour la recherche d'un vaccin contre le SIDA.

Deux projets de calcul partagé travaillent activement dans ce sens.

Rosetta http://www.boinc-af.org/index.php?option=com_content&task=view&id=26&Itemid=219 est actuellement à la pointe de la conception d'un vaccin contre le SIDA, les calculs ont pour but de concevoir de petits imitateurs de la protéine du virus qui produiront des anticorps semblables lorsque les gens seront vaccinés. Rosetta travaille en collaboration avec le groupe du Dr. Kwong qui a récement réussis à fournir une image précise de l'interaction entre la protéine externe du VIH (gp120) et les anticorps servant à la neutraliser. (Voir l'article) http://www.boinc-af.org/index.php?option=com_content&task=view&id=454&Itemid=273

FightAids, ce projet du World Community Grid consiste à comparer des centaines de milliers de molécules naturelles à des centaines de protéase du VIH. La recherche peut alors se résumer à rechercher une molécule qui pourrait parfaitement s'adapter à une protéase. C'est un peu comme si on avait devant nous des centaines de milliers de clés et une centaine de serrures, les différentes combinaisons sont extrêment nombreuses.

Les résultats de ces 2 projets sont publics et entièrement libre de droit (+)
Donc si un vaccin est découvert grâce à un de ces 2 projets, tout les pays en développement auraient les droits de produire des génériques.

Pour Rosetta Inscription en 3 temps :

* Inscription au projet http://boinc.bakerlab.org/rosetta/create_account_form.php?teamid=30

* Télécharger
http://boinc.berkeley.edu/download.php
puis installer BOINC (logiciel open source) - Guide d'installation détaillé
http://www.boinc-af.org/index.php?option=com_content&task=view&id=33&Itemid=149

* Durant l'installation, URL du projet : (http://boinc.bakerlab.org/rosetta/)
Cette adresse est à coller lorsqu'il vous est demandé l'adresse du projet que vous souhaitez rejoindre : http://boinc.bakerlab.org/rosetta/

Modifie par Modifié par cathylbb le 25/03/


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Vivre,c'est sortir du rêve pour le réaliser.
A trop rêver ses rêves,c'est la vie qu'on assassine.


Voulez vous aider la science
25/03-2007 à 09:09Vala, j'ai fini par installer le "truc" et je suis inscrite.
J'ai pas tout compris mais bon... [:D]


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25/03-2007 à 09:25moi j'installe rien du tout [:Z]


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25/03-2007 à 11:39Je n'ai encore rien installé [;)]

Il y a quelques années, j'avais mis "Folding" [:)(]


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